На підставі цих даних 2 липня 1941 року Могилевський арештований.
Розслідуванням, що провадиться у справі, встановлено, що Могилевський, будучи вороже
налаштованим до Радянської влади, систематично в своєму оточенні проводив антирадянську
агітацію. Забезпечував єпископів західних областей України, Білорусії і Прибалтійських республік
...антирадянською наклепницькою інформацією про стан релігії в СРСР з метою виклику
незадоволеності серед віруючих.
У попередньому звинуваченні Могилевський винним себе визнав частково.
Постановою Особливої Наради при Народному Комісаріаті Внутрішніх Справ СРСР
Могилевського Феодосія (Миколу) Никифоровича, як соціально-небезпечного елемента, заслати
до Казахської РСР строком на 5 років, рахуючи термін з 27-го червня 1941 року.
ТЕЖ БЛАГОСЛОВЛЯВ, зі спогадів Н. Штауде
Якось зайшла у нас з владикою Миколою розмова про патріарха Тихона. Виявилось, що Владика
був на його похоронах в Москві весною 1925 року, коли і я була на цвинтарі Донського монастиря.
Віруючі, що зібралися тоді в незчисленній кількості в огорожі, поводилися так дисципліновано,
що я навіть змогла, перебуваючи в першому ряду біля доріжки, якою йшла похоронна процесія, у
момент пронесення труни Святителя звільнити руку з ланцюга і перехреститися: жодна людина
при цьому не поворухнулася, а могли б кинутися і зім’яти передні ряди. Однак всі розуміли, що
внаслідок цього сталася б катастрофа, оскільки десятки тисяч людей були замкнені усередині
огорожі.
А коли нас випускали потім невеликими партіями з воріт монастиря, на даху патріарших спокоїв
стояли єпископи і благословляли тих, хто виходив.
...Я пригадала цю картину і поділилася цим спогадом з Владикою. «Ось і я стояв тоді на даху і
благословляв богомольців, що виходили з воріт, – сказав він, з посмішкою подивившись на мене.
РІДНОЇ МОВИ НЕ ЗАБУВАВ, з «Житія преподобного Феодосія Могилевського»
Народившись в Україні, любив він згадувати свою «рідну мову». Благословляючи народ на
Літургії із словами: «Призри с небесе, Боже, и виждь, и посети виноград сей», іноді повторно
вимовляв цей вигук грецькою, а утретє – українською.